J.D. gesteht seiner Freundin Kim nach der Geburt ihres gemeinsamen Sohnes Sam, dass er sie gar nicht liebt, sondern nur freundschaftliche Gefühle für sie hegt. Außerdem muss er endlich einmal erwachsen werden. Turk erkennt, dass das Leben als Vater nicht immer einfach ist und dass eine kleine Auszeit ab und zu ganz gut tun kann. Mit dieser Meinung steht er nicht alleine da, denn auch seine Frau und Mutter des Kindes, Carla, genehmigt sich hin und wieder gerne einmal eine Pause.
Auch bei Elliot herrscht Gefühlschaos, denn sie ist sich plötzlich nicht mehr so sicher, ob Keith wirklich der Richtige für sie ist. Dr. Kelso soll in Rente gehen, doch die gesamte Belegschaft, insbesondere Carla und Elliot, setzen sich für Dr. Kelso ein, damit er mit seinen nunmehr 65 Jahren bleiben kann.
Es ist das siebte Jahr für J.D. und seine Kollegen im Sacred Heart. Elliot macht nach ihrer Verlobung mit Keith Schluss. (Mein voller Durchblick) Kurz danach wird Sam, der Sohn von J.D. und Kim geboren und J.D. gesteht Kim, dass er sie nicht liebt. (Meine schwere Geburt) Dan besucht J.D. im Sacred Heart und bringt ihm ein neues Auto mit, nachdem ihm J.D. bei seinem letzten Besuch ermutigt hatte, sich einen neuen und besseren Job zu suchen. (Mein Erwachsenwerden) J.D. lernt wegen einer Wette mit dem Hausmeister die Namen aller Mitarbeiter des Krankenhauses, außer einen, den des Hausmeisters. (Meine Eselsbrücken) Weil Elliot eine Geburtstagsfeier für Dr. Kelso machen möchte, kommt sein wahres Alter an das Licht und der Aufsichtsrat will ihn nun in Rente schicken. (Mein inneres Kind) J.D. wird zum Nummer-Eins-Doktor im Sacred Heart gewählt, worauf die anderen ihm seinen Titel streitig machen möchten. (Meine Tabellenführung)
Turk lernt, als Geschenk für Carla, Spanisch, beschließt danach aber, es für sich zu behalten, um es für seinen eigenen Vorteil zu nutzen. Carla bemerkt es jedoch. (Meine Wasserbomben) Der Hausmeister startet seine Zeitung "The Janitorial". (Mein Leben als Mann) Nachdem der Aufsichtsrat das Bleiben von Dr. Kelso genehmigt hatte, kündigt er seinen Job im Sacred Heart (Meine Dusel-Diagnose) und Dr. Cox wird vorübergehend zum Chefarzt befördert. (Mein neuer Chef) J.D. und Elliot arbeiten zusammen an der Diagnose von Patientin Marian. (Mein Märchen)
Die siebte Staffel beinhaltet Songs von Say Anything, Colin Hay, Trik Turner, The Who, Pete Yorn, Jump Little Children, Ben Lee, Modest Mouse, und vielen mehr.
Bei der US-Erstausstrahlung der 7. Staffel wurde die ursprüngliche Reihenfolge verändert: die Folge Mein Märchen wurde als Serien-Finale auf NBC genutzt, so dass die Episoden Meine Dusel-Diagnose und Mein neuer Chef, welche danach geplant waren, als vorherige Folgen ausgestrahlt wurden
. Dies ist auch der Grund, warum Dr. Kelso als Chefarzt im "NBC-Staffelelfinale" auftrat, obwohl er bereits vorher kündigte. Die Serie ging für eine Finale 8. Staffel zum US-Sender ABC. Der Grund war, dass viele Drehbuchautoren wegen zu geringer Gagen in der USA streikten. Zu denen gehörte auch Bill Lawrence, der auch von Scrubs-Darstellern unterstützt wurde. In Deutschland hat ProSieben die Folgen in der richtigen, geplanten Reihenfolge gesendet. Mein Märchen lief hier als Episode Neun der Siebten Staffel. Danach folgten Meine Dusel-Diagnose und Mein neuer Chef als Staffelfinale.
Ursprünglich waren 18 Folge für diese Staffel geplant. Es wurden aber nur 11.
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